Observando esas dos formas verbales, me di cuenta de que ambas son casos muy especiales aún dentro de los verbos irregulares, porque:
- "ES" es la única forma verbal de tercera persona del singular terminada en consonante (además existe sólo en catalán, en las demás lenguas romances se dice "E" o "ESTE")
- "FUE" es la única forma del pretérito perfecto simple terminando en -E, todas las demás formas terminan en -O, sea o no acentuada.

He encontrado este artículo en la Wikipedia en inglés. Según dice, algunas formas verbales del español vienen directamente del latín preclásico (arcaico), ya que fue ésta la lengua que los conquistadores romanos llevaron a la península.

EJEMPLOS:

(Lat. preclás. - lat.clás - esp.)
(e)som - sum - soy
somos - sumus - somos
fuei - fui - fui
fuistei - fuisti - fuiste
fued - fuit - fue
fuemos - fuimus - fuimos
fuisteis - fuistis - fuisteis
fueront - fuerunt - fueron

"Interestingly, many Old Latin forms bear a closer resemblance to those of Modern Spanish than the Classical Latin forms do. Indeed, Spain was the first area outside of Italy conquered by the Romans (in 201 BC), and Old Latin was therefore definitely spoken there, but whether this shows that the Spanish language is more phonologically conservative and more purely "Old Latin"-like than other Romance languages (even Italian) -- as, for example, if somos (or more intriguingly, fuisteis) was always pronounced this way in Spain or if it changed to sumus (fuistis) during the Classical Era then back to somos again -- remains an open question."

La U breve latina da en castellano "o" y la I breve latina da "e".

"Somos" procede de SUMUS, como "mosca" procede de MUSCA y "fue" procede de FUIT como "verde" procede de VIRIDIS.

Además, en francés "somos" es "sommes" y en italiano "soy" es "sono".

Yo tampoco podía creer lo que dice en inglés, pues sería un poco absurdo. Sin embargo todavía que algo extraño: cómo explicas la terminación "-eis" de castellano cuando en latín era "-is"? Aunque puede ser por analogía con el presente: cantáis (< CANTATIS) > cantasteis (< CANTASTIS), sois > fuisteis.

En efecto, es por analogía con el diptongo de la forma de presente. La forma antigua era la etimológica -stes: comistes.